Bos taurus Gene: RXRB | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-628937.3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RXRB | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinoic acid receptor RXR-beta | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000000602 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinoic acid receptor RXR-beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000204231:
This gene encodes a member of the retinoid X receptor (RXR) family of nuclear receptors which are involved in mediating the effects of retinoic acid (RA). The encoded protein forms homodimers with the retinoic acid, thyroid hormone, and vitamin D receptors, increasing both DNA binding and transcriptional function on their respective response elements. This gene lies within the major histocompatibility complex (MHC) class II region on chromosome 6. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 23:7320233-7326944 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 45 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Gene Expression pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Gene Expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
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KEGG |
Non-small cell lung cancer pathway
Thyroid cancer pathway
Small cell lung cancer pathway
PPAR signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
PPAR signaling pathway pathway
Thyroid cancer pathway
Small cell lung cancer pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A6H7I6 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 504943 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.57603 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083640 XM_005223208 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC146260 DAAA02054891 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI46261 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 504943 | ||||||||||||||||||||||||||||