Bos taurus Gene: SCN4B | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631226.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SCN4B | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Sodium channel subunit beta-4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000039340 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Sodium channel subunit beta-4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000177098:
The protein encoded by this gene is one of several sodium channel beta subunits. These subunits interact with voltage-gated alpha subunits to change sodium channel kinetics. The encoded transmembrane protein forms interchain disulfide bonds with SCN2A. Defects in this gene are a cause of long QT syndrome type 10 (LQT10). Three protein-coding and one non-coding transcript variant have been found for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:29257448-29277309 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q08E08 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | V6F7R8 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 538100 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.34480 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076912 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC123479 GJ062397 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI23480 DAA22388 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 538100 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
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