Bos taurus Gene: PDCD6 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632598.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDCD6 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | programmed cell death protein 6 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000046493 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
programmed cell death 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000249915:
This gene encodes a calcium-binding protein belonging to the penta-EF-hand protein family. Calcium binding is important for homodimerization and for conformational changes required for binding to other protein partners. This gene product participates in T cell receptor-, Fas-, and glucocorticoid-induced programmed cell death. In mice deficient for this gene product, however, apoptosis was not blocked suggesting this gene product is functionally redundant. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is also located on the short arm of chromosome 5. [provided by RefSeq, May 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:71916825-71932650 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 41 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q1LZ81 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 100125927 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001105497 XM_005221655 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC116154 DAAA02051474 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI16155 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 100125927 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
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