Homo sapiens Gene: DDX42 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-63647.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX42 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | DDX42P; RHELP; RNAHP; SF3b125; SF3B8 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000198231 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) box protein family. Members of this protein family are putative RNA helicases, and are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Members of this family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. Two transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:63773603-63819317 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q23.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 46 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.627787 Hs.690897 Hs.692427 Hs.702010 Hs.731874 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007372 NM_203499 XM_006721657 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32704 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09909 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||