Bos taurus Gene: TRIM32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-638754.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TRIM32 targets TMEM173 for ubiquitination and enhances the induction of IFNB against RNA and DNA viruses.
[Homo sapiens] TRIM32 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
[Mus musculus] Trim32 targets Tmem173 for ubiquitination and enhances the induction of Ifnb against RNA and DNA viruses. (Demonstrated in human)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000119401:
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies. The protein has also been localized to the nucleus, where it interacts with the activation domain of the HIV-1 Tat protein. The Tat protein activates transcription of HIV-1 genes. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:107645159-107656813 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 40 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Innate Immune System pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Innate Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Adaptive Immune System pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
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KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q0VCP5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 521975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.62175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001075824 XM_005210576 XM_005210577 XM_005210578 XM_005210579 XM_005210580 XM_005210581 XM_005210582 XM_005210583 XM_005210584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC120073 DAAA02024639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI20074 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 521975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||