Bos taurus Gene: CHD4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640327.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000014734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Uncharacterized protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111642:
The product of this gene belongs to the SNF2/RAD54 helicase family. It represents the main component of the nucleosome remodeling and deacetylase complex and plays an important role in epigenetic transcriptional repression. Patients with dermatomyositis develop antibodies against this protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] The product of this gene belongs to the SNF2/RAD54 helicase family. It represents the main component of the nucleosome remodeling and deacetylase complex and plays an important role in epigenetic transcriptional repression. Patients with dermatomyositis develop antibodies against this protein. Somatic mutations in this gene are associated with serous endometrial tumors. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:104186061-104214563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 88 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Gene Expression pathway
HDACs deacetylate histones pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A7E3C8 A8KC83 F1N3F6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 506402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.45213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206501 XM_005207112 XM_005207113 XM_005207114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC151803 BC154398 DAAA02014463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI51804 AAI54399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 506402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||