Bos taurus Gene: BT.29882 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644985.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.29882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | microphthalmia-associated transcription factor isoform M- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000006679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
microphthalmia-associated transcription factor isoform M-
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000187098:
This gene encodes a transcription factor that contains both basic helix-loop-helix and leucine zipper structural features. It regulates the differentiation and development of melanocytes retinal pigment epithelium and is also responsible for pigment cell-specific transcription of the melanogenesis enzyme genes. Heterozygous mutations in the this gene cause auditory-pigmentary syndromes, such as Waardenburg syndrome type 2 and Tietz syndrome. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:31735990-31769463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 33 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
KitReceptor pathway
RANKL pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Melanoma pathway
Melanogenesis pathway
Pathways in cancer pathway
Osteoclast differentiation pathway
Melanogenesis pathway
Melanoma pathway
Pathways in cancer pathway
Osteoclast differentiation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
Regulation of nuclear beta catenin signaling and target gene transcription
Signaling events mediated by Stem cell factor receptor (c-Kit)
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
IL6-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MCS8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 407219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001001150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02054059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 407219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||