| Homo sapiens Gene: GYPC | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-68658.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | GYPC | ||||||||||||||||||
| Gene Name | glycophorin C (Gerbich blood group) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | CD236; CD236R; GE; GPC; GPD; GYPD; PAS-2; PAS-2\' | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000136732 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
glycophorin C (Gerbich blood group)
glycophorin C (Gerbich blood group)
glycophorin C (Gerbich blood group)
|
||||||||||||||||||
| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
Glycophorin C (GYPC) is an integral membrane glycoprotein. It is a minor species carried by human erythrocytes, but plays an important role in regulating the mechanical stability of red cells. A number of glycophorin C mutations have been described. The Gerbich and Yus phenotypes are due to deletion of exon 3 and 2, respectively. The Webb and Duch antigens, also known as glycophorin D, result from single point mutations of the glycophorin C gene. The glycophorin C protein has very little homology with glycophorins A and B. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2012] |
||||||||||||||||||
| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 2:126655933-126696675 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | q14.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
|
||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
| Biological Process |
|
||||||||||||||||||
| Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
| Orthologs | |||||||||||||||||||
|
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Malaria pathway
|
||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.59138 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001256584 NM_002101 NM_016815 XM_006712460 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS2136 CCDS46402 CCDS58724 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 00193 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||