Homo sapiens Gene: NCOA6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68724.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NCOA6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor coactivator 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AIB3; ASC2; NRC; PRIP; RAP250; TRBP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000198646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear receptor coactivator 6
nuclear receptor coactivator 6
nuclear receptor coactivator 6
nuclear receptor coactivator 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a transcriptional coactivator that can interact with nuclear hormone receptors to enhance their transcriptional activator functions. This protein has been shown to be involved in the hormone-dependent coactivation of several receptors, including prostanoid, retinoid, vitamin D3, thyroid hormone, and steroid receptors. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:34696918-34825649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 119 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Orphan transporters pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F6M2K2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001242539 NM_014071 XM_005260348 XM_006723750 XM_006723753 XM_006723754 XM_006723755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS74720 CCDS13241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | JF707637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AEG79564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 23054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||