Homo sapiens Gene: JMJD6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-70010.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | JMJD6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | jumonji domain containing 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PSR; PTDSR; PTDSR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000070495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Reversible arginine methylation of TRAF6 is regulated by PRMT1 and JMJD6 and this in turn regulates TRAF6-dependent TLR signalling.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein with a JmjC domain. JmjC domain-containing proteins are predicted to function as protein hydroxylases or histone demethylases. This protein was first identified as a putative phosphatidylserine receptor involved in phagocytosis of apoptotic cells; however, subsequent studies have indicated that it does not directly function in the clearance of apoptotic cells, and questioned whether it is a true phosphatidylserine receptor. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:76712832-76726799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q25.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 93 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.514505 Hs.617513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081461 NM_015167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS42383 CCDS42384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05371 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||