Homo sapiens Gene: PVRL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-74533.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PVRL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD111; CLPED1; ED4; HIgR; HV1S; HVEC; nectin-1; OFC7; PRR; PRR1; PVRR; PVRR1; SK-12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000110400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C)
poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C)
poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an adhesion protein that plays a role in the organization of adherens junctions and tight junctions in epithelial and endothelial cells. The protein is a calcium(2+)-independent cell-cell adhesion molecule that belongs to the immunoglobulin superfamily and has 3 extracellular immunoglobulin-like loops, a single transmembrane domain (in some isoforms), and a cytoplasmic region. This protein acts as a receptor for glycoprotein D (gD) of herpes simplex viruses 1 and 2 (HSV-1, HSV-2), and pseudorabies virus (PRV) and mediates viral entry into epithelial and neuronal cells. Mutations in this gene cause cleft lip and palate/ectodermal dysplasia 1 syndrome (CLPED1) as well as non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (CL/P). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding proteins with distinct C-termini. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:119623408-119729084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nectin/Necl trans heterodimerization pathway
Adherens junctions interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Adherens junction pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Nectin adhesion pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q15223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6SYC0 Q6SYC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.334846 Hs.618202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002855 NM_203285 NM_203286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8425 CCDS8426 CCDS8427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF060231 AF196768 AF196769 AF196770 AF196771 AF196772 AF196773 AF196774 AF252867 AY029539 AY445577 AY445578 AY445580 AY445581 BC104948 BC113471 X76400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC23798 AAG16648 AAG16649 AAI04949 AAI13472 AAK33124 AAR88250 AAR88252 CAA53980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||