Homo sapiens Gene: POLR1C | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-88354.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POLR1C | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | polymerase (RNA) I polypeptide C, 30kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RPA39; RPA40; RPA5; RPAC1; TCS3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000171453 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
polymerase (RNA) I polypeptide C, 30kDa
polymerase (RNA) I polypeptide C, 30kDa
polymerase (RNA) I polypeptide C, 30kDa
polymerase (RNA) I polypeptide C, 30kDa
polymerase (RNA) I polypeptide C, 30kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a subunit of both RNA polymerase I and RNA polymerase III complexes. The encoded protein is part of the Pol core element. Defects in this gene have been associated with Treacher Collins syndrome (TCS). [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:43509702-43529585 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 60 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription Termination pathway
RNA Polymerase III Chain Elongation pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter pathway
RNA Polymerase I Transcription Termination pathway
RNA Polymerase I Chain Elongation pathway
RNA Polymerase I Promoter Escape pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation pathway
Innate Immune System pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Immune System pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Pyrimidine metabolism pathway
Purine metabolism pathway
RNA polymerase pathway
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RDJ3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9533 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.632895 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_203290 XM_005249491 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20194 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 610060 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4901 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09661 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL355802 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9533 | ||||||||||||||||||||||