Homo sapiens Gene: PDPN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-90582.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDPN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | podoplanin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AGGRUS; GP36; Gp38; GP40; HT1A-1; OTS8; PA2.26; T1A; T1A-2; T1A2; TI1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000162493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
podoplanin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a type-I integral membrane glycoprotein with diverse distribution in human tissues. The physiological function of this protein may be related to its mucin-type character. The homologous protein in other species has been described as a differentiation antigen and influenza-virus receptor. The specific function of this protein has not been determined but it has been proposed as a marker of lung injury. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:13583465-13617957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p36.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.468675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001006624 NM_001006625 NM_006474 NM_198389 XM_006710295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:29602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 608863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30602 CCDS41266 CCDS44060 CCDS53270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 16398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||