Homo sapiens Gene: LCK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95667.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LCK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lymphocyte-specific protein tyrosine kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IMD22; LSK; p56lck; pp58lck; YT16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000182866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
lymphocyte-specific protein tyrosine kinase
LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the Src family of protein tyrosine kinases (PTKs). The encoded protein is a key signaling molecule in the selection and maturation of developing T-cells. It contains N-terminal sites for myristylation and palmitylation, a PTK domain, and SH2 and SH3 domains which are involved in mediating protein-protein interactions with phosphotyrosine-containing and proline-rich motifs, respectively. The protein localizes to the plasma membrane and pericentrosomal vesicles, and binds to cell surface receptors, including CD4 and CD8, and other signaling molecules. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:32251239-32286165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p35.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 168 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
EGFR1 pathway
TCR pathway
BCR pathway
IL2 pathway
IL3 pathway
IL4 pathway
Leptin pathway
TSLP pathway
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REACTOME |
PIP3 activates AKT signaling pathway
DAP12 signaling pathway
DAP12 interactions pathway
Downstream TCR signaling pathway
Generation of second messenger molecules pathway
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse pathway
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains pathway
Interleukin-2 signaling pathway
CTLA4 inhibitory signaling pathway
CD28 dependent PI3K/Akt signaling pathway
CD28 dependent Vav1 pathway pathway
CD28 co-stimulation pathway
PD-1 signaling pathway
Costimulation by the CD28 family pathway
PECAM1 interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
PI3K/AKT activation pathway
GAB1 signalosome pathway
Signaling by EGFR pathway
PI3K events in ERBB4 signaling pathway
Signaling by ERBB4 pathway
PI3K events in ERBB2 signaling pathway
Signaling by ERBB2 pathway
PI-3K cascade pathway
Signaling by FGFR pathway
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Nef and signal transduction pathway
Nef Mediated CD4 Down-regulation pathway
Constitutive PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by EGFR in Cancer pathway
Downstream signaling of activated FGFR pathway
TCR signaling pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Signal Transduction pathway
Nef-mediates down modulation of cell surface receptors by recruiting them to clathrin adapters pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
HIV Infection pathway
PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
The role of Nef in HIV-1 replication and disease pathogenesis pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
Downstream signaling events of B Cell Receptor (BCR) pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
T cell receptor signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Primary immunodeficiency pathway
Osteoclast differentiation pathway
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INOH |
CD4 T cell receptor signaling pathway
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
B cell receptor signaling pathway
Integrin signaling pathway pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
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PID NCI |
Atypical NF-kappaB pathway
TCR signaling in naïve CD8+ T cells
IL2-mediated signaling events
CXCR4-mediated signaling events
TCR signaling in naïve CD4+ T cells
IL12-mediated signaling events
SHP2 signaling
IL2 signaling events mediated by STAT5
IL2 signaling events mediated by PI3K
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.470627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001042771 NM_005356 XM_005270864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||