Homo sapiens Gene: PBX1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-104447.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PBX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | pre-B-cell leukemia homeobox 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000185630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
pre-B-cell leukemia homeobox 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein that belongs to the PBX homeobox family of transcriptional factors. Studies in mice suggest that this gene may be involved in the regulation of osteogenesis, and required for skeletal patterning and programming. A chromosomal translocation, t(1;19) involving this gene and TCF3/E2A gene, is associated with pre-B-cell acute lymphoblastic leukemia. The resulting fusion protein, in which the DNA binding domain of E2A is replaced by the DNA binding domain of this protein, transforms cells by constitutively activating transcription of genes regulated by the PBX protein family. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:164555584-164899296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 63 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Glucocorticoid receptor regulatory network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H0YLD4 H0YLM3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.557097 Hs.595163 Hs.603299 Hs.707188 Hs.720898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001204961 NM_001204963 NM_002585 XM_005245228 XM_005245229 XM_005245230 XM_006711347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 176310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1246 CCDS55654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL357568 AL359255 AL390119 AL391001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||