Bos taurus Gene: PBX1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-629771.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PBX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | pre-B-cell leukemia transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000013801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
pre-B-cell leukemia homeobox 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000185630:
This gene encodes a nuclear protein that belongs to the PBX homeobox family of transcriptional factors. Studies in mice suggest that this gene may be involved in the regulation of osteogenesis, and required for skeletal patterning and programming. A chromosomal translocation, t(1;19) involving this gene and TCF3/E2A gene, is associated with pre-B-cell acute lymphoblastic leukemia. The resulting fusion protein, in which the DNA binding domain of E2A is replaced by the DNA binding domain of this protein, transforms cells by constitutively activating transcription of genes regulated by the PBX protein family. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:4228463-4527283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 45 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Glucocorticoid receptor regulatory network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MJ02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 540688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.78230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192768 XM_005203438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02006829 DAAA02006830 DAAA02006831 DAAA02006832 DAAA02006833 DAAA02006834 DAAA02006835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 540688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||