Mus musculus Gene: Suv39h1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-130058.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Suv39h1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | suppressor of variegation 3-9 homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI852103; AL022883; DXHXS7466e; H3-K9-HMTase 1; KMT1A; mIS6 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000039231 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
suppressor of variegation 3-9 homolog 1 (Drosophila)
suppressor of variegation 3-9 homolog 1 (Drosophila)
suppressor of variegation 3-9 homolog 1 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101945:
This gene is a member of the suppressor of variegation 3-9 homolog family and encodes a protein with a chromodomain and a C-terminal SET domain. This nuclear protein moves to the centromeres during mitosis and functions as a histone methyltransferase, methylating Lys-9 of histone H3. Overall, it plays a vital role in heterochromatin organization, chromosome segregation, and mitotic progression. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes an evolutionarily-conserved protein containing an N-terminal chromodomain and a C-terminal SET domain. The encoded protein is a histone methyltransferase that trimethylates lysine 9 of histone H3, which results in transcriptional gene silencing. Loss of function of this gene disrupts heterochromatin formation and may cause chromosome instability. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:8061171-8074760 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | A1.1 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 53 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Epigenetic regulation of gene expression pathway
SIRT1 negatively regulates rRNA Expression pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Epigenetic regulation of gene expression pathway
SIRT1 negatively regulates rRNA Expression pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.452914 Mm.479743 Mm.479817 Mm.9244 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001290716 NM_011514 XM_006527575 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40846 CCDS72337 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||