Bos taurus Gene: BT.25870 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636872.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.25870 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000004706 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101945:
This gene is a member of the suppressor of variegation 3-9 homolog family and encodes a protein with a chromodomain and a C-terminal SET domain. This nuclear protein moves to the centromeres during mitosis and functions as a histone methyltransferase, methylating Lys-9 of histone H3. Overall, it plays a vital role in heterochromatin organization, chromosome segregation, and mitotic progression. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes an evolutionarily-conserved protein containing an N-terminal chromodomain and a C-terminal SET domain. The encoded protein is a histone methyltransferase that trimethylates lysine 9 of histone H3, which results in transcriptional gene silencing. Loss of function of this gene disrupts heterochromatin formation and may cause chromosome instability. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:91856090-91868994 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 50 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Epigenetic regulation of gene expression pathway
SIRT1 negatively regulates rRNA Expression pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
SIRT1 negatively regulates rRNA Expression pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Lysine degradation pathway
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3X6G5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 523047 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.25870 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001046264 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02073067 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 523047 | ||||||||||||||||||||||