Mus musculus Gene: Taf3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135430.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Taf3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025782 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000165632:
The highly conserved RNA polymerase II transcription factor TFIID (see TAF1; MIM 313650) comprises the TATA box-binding protein (TBP; MIM 600075) and a set of TBP-associated factors (TAFs), including TAF3. TAFs contribute to promoter recognition and selectivity and act as antiapoptotic factors (Gangloff et al., 2001 [PubMed 11438666]).[supplied by OMIM, May 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:9914552-10048596 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
Gene Expression pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
HIV Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape pathway
Transcription of the HIV genome pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.86343 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_027748 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15675 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||