Mus musculus Gene: Tnfaip3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135792.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tnfaip3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A20; Tnfip3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Tnfaip3 expression and Tnfaip3-Irak1interaction are important for endotoxin tolerance. Tnfaip3 overexpression inhibits LPS-induced activation of NFKB, and is mechanistically linked to endotoxin tolerance through the reprogramming of Tlr4 signaling.
Tnfaip3 promotes intestinal epithelial barrier integrity and inhibits LPS-induced loss of the tight junction protein occludin.
Tnfaip3 is regulated by both Nf-κB and p38-dependent Cebpb in response to LPS in macrophages.
Mirlet7f and its target Tnfaip3 regulate immune responses to Mycobacterium tuberculosis and control bacterial burden by augmenting the production of Tnf and Il1b.
Sqstm1 captures Tnfaip3, an NFkB inhibitor, and sequesters it in the autophagosome. This allows macrophages to release chemokines that recruit neutrophils and boost antifungal immunity.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TNFAIP3 restricts TLR signals by restricting ubiquitination of TRAF6 and restricts MyD88-independent TLR signals by inhibiting Toll/interleukin 1 receptor domain-containing adaptor inducing interferon (IFN) beta (TICAM1)-dependent nuclear factor kappaB signals but not IFN response factor 3 signalling.
[Homo sapiens] TNFAIP3 restricts NOD2 triggered signals by deubiquitinating RIPK2.
[Homo sapiens] TNFAIP3 negatively regulates the RIG-I antiviral state by blocking IRF- and NF-kappaB-mediated gene expression.
[Homo sapiens] TNFAIP3 negatively regulates BCL10- and CARMA3-mediated activation of NF-kappaB by means of its deubiquitylation activity and preventing assembly of the complex containing CARMA3, BCL10 and IKBKG (NEMO).
[Homo sapiens] TNFAIP3 removes lysine-63 linked ubiquitin chains from RIPK1 and polyubiquitinates RIPK1 with K48-linked ubiquitin chains, targeting it for proteosomal degradation, and hence down-regulating NF-kappaB signalling pathway.
[Homo sapiens] TNFAIP3 is phosphorylated by IKBKB and this increases the ability of TNFAIP3 to inhibit the NF-kappaB signalling pathway.
[Homo sapiens] TNFAIP3 is an early NF-kappaB-responsive gene that encodes a ubiquitin-editing protein that is involved in the negative feedback regulation of NF-kappaB signalling and thus is a central gatekeeper in inflammation and immunity.
[Homo sapiens] TNFAIP3 (A20) and TAX1BP1 inhibit antiviral signaling by targeting TBK1/IKKi kinases and disrupting a TRAF3-TBK1-IKKi signalling complex.
[Homo sapiens] TNFAIP3 and TRAF6 differentially regulate TLR4-induced autophagy during inflammatory responses by modulating K63-linked ubiquitination of BECN1 (Beclin 1).
[Homo sapiens] TNFAIP3 is a deubiquitinase that counteracts E3 ligases and therefore play a prominent role in the down-regulation of NF-κB signalling and homeostasis.
[Homo sapiens] TNFAIP3 expression and TNFAIP3-IRAK1interaction are important for endotoxin tolerance. TNFAIP3 over-expression inhibits LPS-induced activation of NFKB, and is mechanistically linked to endotoxin tolerance through the reprogramming of TLR4 signalling.
[Homo sapiens] TNFAIP3 promotes intestinal epithelial barrier integrity and inhibits LPS-induced loss of the tight junction protein occludin. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] Haploinsufficiency of A20 (HA20) is caused by high-penetrance loss-of-function germline mutations in TNFAIP3 with increased degradation of NFKBIA, nuclear translocation of RELA, increased expression of NFκB mediated proinflammatory cytokines, and defective deubiquitinating activity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000118503:
This gene was identified as a gene whose expression is rapidly induced by the tumor necrosis factor (TNF). The protein encoded by this gene is a zinc finger protein and ubiqitin-editing enzyme, and has been shown to inhibit NF-kappa B activation as well as TNF-mediated apoptosis. The encoded protein, which has both ubiquitin ligase and deubiquitinase activities, is involved in the cytokine-mediated immune and inflammatory responses. Several transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:19000910-19015657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 38 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 67 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
Immune System pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
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KEGG |
NOD-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Innate Immune System pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Immune System pathway
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KEGG |
NOD-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CD40/CD40L signaling
TNF receptor signaling pathway
Canonical NF-kappaB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q60769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YXE1 D3Z5R6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.116683 Mm.472346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009397 XM_006512702 NM_001166402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1196377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tnfaip3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC102657 AK151921 U19463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC52153 BAE30799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||