Bos taurus Gene: TNFAIP3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-633691.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNFAIP3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor necrosis factor alpha-induced protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000000436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TNFAIP3 restricts TLR signals by restricting ubiquitination of TRAF6 and restricts MyD88-independent TLR signals by inhibiting Toll/interleukin 1 receptor domain-containing adaptor inducing interferon (IFN) beta (TICAM1)-dependent nuclear factor kappaB signals but not IFN response factor 3 signalling.
[Homo sapiens] TNFAIP3 restricts NOD2 triggered signals by deubiquitinating RIPK2.
[Homo sapiens] TNFAIP3 negatively regulates the RIG-I antiviral state by blocking IRF- and NF-kappaB-mediated gene expression.
[Homo sapiens] TNFAIP3 negatively regulates BCL10- and CARMA3-mediated activation of NF-kappaB by means of its deubiquitylation activity and preventing assembly of the complex containing CARMA3, BCL10 and IKBKG (NEMO).
[Homo sapiens] TNFAIP3 removes lysine-63 linked ubiquitin chains from RIPK1 and polyubiquitinates RIPK1 with K48-linked ubiquitin chains, targeting it for proteosomal degradation, and hence down-regulating NF-kappaB signalling pathway.
[Homo sapiens] TNFAIP3 is phosphorylated by IKBKB and this increases the ability of TNFAIP3 to inhibit the NF-kappaB signalling pathway.
[Homo sapiens] TNFAIP3 is an early NF-kappaB-responsive gene that encodes a ubiquitin-editing protein that is involved in the negative feedback regulation of NF-kappaB signalling and thus is a central gatekeeper in inflammation and immunity.
[Homo sapiens] TNFAIP3 (A20) and TAX1BP1 inhibit antiviral signaling by targeting TBK1/IKKi kinases and disrupting a TRAF3-TBK1-IKKi signalling complex.
[Homo sapiens] TNFAIP3 and TRAF6 differentially regulate TLR4-induced autophagy during inflammatory responses by modulating K63-linked ubiquitination of BECN1 (Beclin 1).
[Homo sapiens] TNFAIP3 is a deubiquitinase that counteracts E3 ligases and therefore play a prominent role in the down-regulation of NF-κB signalling and homeostasis.
[Homo sapiens] TNFAIP3 expression and TNFAIP3-IRAK1interaction are important for endotoxin tolerance. TNFAIP3 over-expression inhibits LPS-induced activation of NFKB, and is mechanistically linked to endotoxin tolerance through the reprogramming of TLR4 signalling.
[Homo sapiens] TNFAIP3 promotes intestinal epithelial barrier integrity and inhibits LPS-induced loss of the tight junction protein occludin. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] Haploinsufficiency of A20 (HA20) is caused by high-penetrance loss-of-function germline mutations in TNFAIP3 with increased degradation of NFKBIA, nuclear translocation of RELA, increased expression of NFκB mediated proinflammatory cytokines, and defective deubiquitinating activity.
[Mus musculus] Tnfaip3 expression and Tnfaip3-Irak1interaction are important for endotoxin tolerance. Tnfaip3 overexpression inhibits LPS-induced activation of NFKB, and is mechanistically linked to endotoxin tolerance through the reprogramming of Tlr4 signaling.
[Mus musculus] Tnfaip3 promotes intestinal epithelial barrier integrity and inhibits LPS-induced loss of the tight junction protein occludin.
[Mus musculus] Tnfaip3 is regulated by both Nf-κB and p38-dependent Cebpb in response to LPS in macrophages.
[Mus musculus] Mirlet7f and its target Tnfaip3 regulate immune responses to Mycobacterium tuberculosis and control bacterial burden by augmenting the production of Tnf and Il1b.
[Mus musculus] Sqstm1 captures Tnfaip3, an NFkB inhibitor, and sequesters it in the autophagosome. This allows macrophages to release chemokines that recruit neutrophils and boost antifungal immunity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000118503:
This gene was identified as a gene whose expression is rapidly induced by the tumor necrosis factor (TNF). The protein encoded by this gene is a zinc finger protein and ubiqitin-editing enzyme, and has been shown to inhibit NF-kappa B activation as well as TNF-mediated apoptosis. The encoded protein, which has both ubiquitin ligase and deubiquitinase activities, is involved in the cytokine-mediated immune and inflammatory responses. Several transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:76766557-76776874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 72 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Innate Immune System pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Immune System pathway
Innate Immune System pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
Immune System pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
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KEGG |
NOD-like receptor signaling pathway pathway
NOD-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CD40/CD40L signaling
TNF receptor signaling pathway
Canonical NF-kappaB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BKC3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 508105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.87748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192170 XM_005210987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02026758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 508105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||