Mus musculus Gene: Sf1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-136142.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sf1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | splicing factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BBP; MZFM; WBP4; Zfp162 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024949 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000168066:
This gene encodes a nuclear pre-mRNA splicing factor. The encoded protein specifically recognizes the intron branch point sequence and is required for the early stages of spliceosome assembly. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:6363690-6378030 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 62 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.256422 Mm.408360 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001110791 NM_011750 XM_006531736 XM_006531737 XM_006531738 XM_006531739 XM_006531740 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50368 CCDS50369 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||