Homo sapiens Gene: FXR1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-66609.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FXR1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | fragile X mental retardation, autosomal homolog 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | FXR1P | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000114416 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
fragile X mental retardation, autosomal homolog 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
FXR1 is an essential component of a network of nuclear receptors that regulate intestinal innate immunity and homeostasis.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is an RNA binding protein that interacts with the functionally-similar proteins FMR1 and FXR2. These proteins shuttle between the nucleus and cytoplasm and associate with polyribosomes, predominantly with the 60S ribosomal subunit. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:180868141-180982753 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q26.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 45 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.478407 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001013438 NM_001013439 NM_005087 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3238 CCDS33894 CCDS46965 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02892 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||