Mus musculus Gene: Efnb1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-161815.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Efnb1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ephrin B1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Cek5-L; EFL-3; Elk-L; Epl2; Eplg2; LERK-2; Lerk2; Stra1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031217 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ephrin B1
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Protein Structure |
![]() |
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Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000090776:
The protein encoded by this gene is a type I membrane protein and a ligand of Eph-related receptor tyrosine kinases. It may play a role in cell adhesion and function in the development or maintenance of the nervous system. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:99136130-99148991 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Ephrin signaling pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Developmental Biology pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Axon guidance pathway
Ephrin signaling pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
EPHB forward signaling
Ephrin B reverse signaling
EphrinB-EPHB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P52795 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q544L9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13641 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.3374 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010110 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30298 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:102708 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Efnb1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK034996 BC006797 BC021656 CH466564 U07598 U07599 U07600 U07602 U12983 Z48781 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA53231 AAC53247 AAH06797 AAH21656 BAC28907 CAA88695 EDL14195 EDL14196 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13641 | ||||||||||||||||||||||