Mus musculus Gene: Gabrg2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-163458.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gabrg2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | GABAA-R; Gabrg-2; gamma2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020436 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 2
gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 2
gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA)-A receptor subunit, which is a member of the ligand-gated ion channel family. GABA is the major inhibitory neurotransmitter in the adult central nervous system, and conversely exhibits an excitatory function during development. GABA-A receptors are pentameric, consisting of proteins from several subunit classes: alpha, beta, gamma, delta and rho. This gene encodes one of three gamma subunits in mammals, which contain the binding site for benzodiazepine drugs. Several mutations in this gene are associated with epileptic seizures, and genetic knockdown is associated with anxiety behavior. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:41910203-42000857 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GABA A receptor activation pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Orphan transporters pathway
Ligand-gated ion channel transport pathway
Ion channel transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
GABA receptor activation pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Ligand-gated ion channel transport pathway
GABA A receptor activation pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
GABA receptor activation pathway
Orphan transporters pathway
Ion channel transport pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399939 Mm.447825 Mm.5309 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008073 NM_177408 XM_006532199 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24551 CCDS24552 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||