Homo sapiens Gene: AICDA | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17253.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | AICDA | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | activation-induced cytidine deaminase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000111732 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
activation-induced cytidine deaminase
activation-induced cytidine deaminase
activation-induced cytidine deaminase
activation-induced cytidine deaminase
activation-induced cytidine deaminase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) infection results in upregulation of AICDA in primary human tonsillar B cells. Two KSHV miRNAs, K12-11 and K12-5 interact with the 3â?²UTR of AICDA to translationally repress its expression.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a RNA-editing deaminase that is a member of the cytidine deaminase family. The protein is involved in somatic hypermutation, gene conversion, and class-switch recombination of immunoglobulin genes. Defects in this gene are the cause of autosomal recessive hyper-IgM immunodeficiency syndrome type 2 (HIGM2). [provided by RefSeq, Feb 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:8602166-8612871 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 69 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Primary immunodeficiency pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH |
Pyrimidine nucleotides nucleosides metabolism pathway
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PID NCI |
IL4-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.149342 Hs.610125 Hs.649749 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_020661 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41747 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05585 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||