Mus musculus Gene: Runx1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-177713.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Runx1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | runt related transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AML1; CBF-alpha-2; Cbfa2; Pebp2a2; Pebpa2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
runt related transcription factor 1
runt related transcription factor 1
runt related transcription factor 1
runt related transcription factor 1
runt related transcription factor 1
runt related transcription factor 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000159216:
Core binding factor (CBF) is a heterodimeric transcription factor that binds to the core element of many enhancers and promoters. The protein encoded by this gene represents the alpha subunit of CBF and is thought to be involved in the development of normal hematopoiesis. Chromosomal translocations involving this gene are well-documented and have been associated with several types of leukemia. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:92601466-92826149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 49 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 80 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Acute myeloid leukemia pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
TGF_beta_Receptor pathway
RANKL pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Acute myeloid leukemia pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated transcriptional targets of deltaNp63 isoforms
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.403285 Mm.4081 Mm.470227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001111021 NM_001111022 NM_001111023 NM_009821 XM_006522882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28339 CCDS49916 CCDS49917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||