Mus musculus Gene: Cnpy3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-188345.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cnpy3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | canopy 3 homolog (zebrafish) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1600025D17Rik; 2410050O22Rik; AI413153; CAG4A; ERDA5; PRAT4A; Tnrc5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023973 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
canopy 3 homolog (zebrafish)
canopy 3 homolog (zebrafish)
canopy 3 homolog (zebrafish)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] CNPY3 differentially interacts with TLR2, TLR4, and TLR9 and a single-nucleotide change in the CNPY3 gene can influence the strength of TLR responses and may also alter the relative activity of each TLR.
[Homo sapiens] CNPY3 (PRAT4A) is required for TLR-dependent immune responses where it regulates the subcellular distribution and response of multiple TLRs, required for both innate and adaptive immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000137161:
PRAT4A is associated with the immature form of TLR4 (MIM 603030) and regulates its cell surface expression (Wakabayashi et al., 2006 [PubMed 16849487]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:46735705-46752214 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Trafficking and processing of endosomal TLR pathway
Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Trafficking and processing of endosomal TLR pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.240325 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_028065 XM_006524957 XM_006524958 XM_006524959 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28839 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||