Version 5.4
| Homo sapiens Gene: CNPY3 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-87405.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | CNPY3 | ||||||||||||||||||||||
| Gene Name | canopy 3 homolog (zebrafish) | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | CAG4A; ERDA5; PRAT4A; TNRC5 | ||||||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000137161 | ||||||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
canopy 3 homolog (zebrafish)
canopy 3 homolog (zebrafish)
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Summary |
CNPY3 differentially interacts with TLR2, TLR4, and TLR9 and a single-nucleotide change in the CNPY3 gene can influence the strength of TLR responses and may also alter the relative activity of each TLR.
CNPY3 (PRAT4A) is required for TLR-dependent immune responses where it regulates the subcellular distribution and response of multiple TLRs, required for both innate and adaptive immune responses.
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| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| Summary |
PRAT4A is associated with the immature form of TLR4 (MIM 603030) and regulates its cell surface expression (Wakabayashi et al., 2006 [PubMed 16849487]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 6:42929192-42939287 | ||||||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
| Band | p21.1 | ||||||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||||||
| REACTOME |
Trafficking and processing of endosomal TLR pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Immune System pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9BT09 | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 10695 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | |||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_006586 | ||||||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:11968 | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | 610774 | ||||||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS4875 | ||||||||||||||||||||||
| HPRD | 06745 | ||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | AF161347 AK090425 AL035587 AY358960 BC004423 BC008133 BC008898 BC008961 BC022093 U80744 | ||||||||||||||||||||||
| GenPept | AAB91442 AAF28907 AAH04423 AAH08898 AAH08961 AAH22093 AAQ89319 BAC03406 CAB75301 | ||||||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 10695 | ||||||||||||||||||||||