Mus musculus Gene: Slc5a7 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-191020.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc5a7 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 5 (choline transporter), member 7 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CHT1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023945 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 5 (choline transporter), member 7
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Protein Structure |
![]() |
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Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000115665:
Choline is a direct precursor of acetylcholine (ACh), a neurotransmitter of the central and peripheral nervous system that regulates a variety of autonomic, cognitive, and motor functions. SLC5A7 is a Na(+)- and Cl(-)- dependent high-affinity transporter that mediates the uptake of choline for acetylcholine synthesis in cholinergic neurons (Apparsundaram et al., 2000 [PubMed 11027560]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:54273594-54299034 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of glucose and other sugars, bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Neurotransmitter Release Cycle pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of glucose and other sugars, bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds pathway
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Neurotransmitter Release Cycle pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BGY9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 63993 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.155241 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_022025 XM_006524774 XM_006524775 XM_006524776 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28885 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1927126 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Slc5a7 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF276872 AJ401467 AK034415 AK053063 BC065089 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG36945 AAH65089 BAC28702 BAC35253 CAC03719 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 63993 | ||||||||||||||||||||||