Mus musculus Gene: Nfasc | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-192274.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nfasc | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | neurofascin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026442 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
neurofascin
neurofascin
neurofascin
neurofascin
neurofascin
neurofascin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an L1 family immunoglobulin cell adhesion molecule with multiple IGcam and fibronectin domains. The protein functions in neurite outgrowth, neurite fasciculation, and organization of the axon initial segment (AIS) and nodes of Ranvier on axons during early development. Both the AIS and nodes of Ranvier contain high densities of voltage-gated Na+ (Nav) channels which are clustered by interactions with cytoskeletal and scaffolding proteins including this protein, gliomedin, ankyrin 3 (ankyrin-G), and betaIV spectrin. This protein links the AIS extracellular matrix to the intracellular cytoskeleton. This gene undergoes extensive alternative splicing, and the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, May 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:132564690-132741797 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
Axon guidance pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Neurofascin interactions pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neurofascin interactions pathway
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001160316 NM_001160317 NM_001160318 NM_182716 XM_006529640 XM_006529641 XM_006529642 XM_006529643 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35707 CCDS48358 CCDS48359 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||