Mus musculus Gene: Hmgcl | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197422.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hmgcl | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AW476067; HL | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028672 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000117305:
The protein encoded by this gene belongs to the HMG-CoA lyase family. It is a mitochondrial enzyme that catalyzes the final step of leucine degradation and plays a key role in ketone body formation. Mutations in this gene are associated with HMG-CoA lyase deficiency. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:135946448-135962617 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Synthesis of Ketone Bodies pathway
Ketone body metabolism pathway
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KEGG |
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Synthesis and degradation of ketone bodies pathway
Butanoate metabolism pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of Ketone Bodies pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Ketone body metabolism pathway
Metabolism pathway
Synthesis of Ketone Bodies pathway
Ketone body metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
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KEGG |
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Butanoate metabolism pathway
Synthesis and degradation of ketone bodies pathway
Peroxisome pathway
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INOH |
Butanoate metabolism pathway
Pyruvate metabolism pathway
Valine Leucine Isoleucine degradation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.482102 Mm.486632 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008254 XM_006538563 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18795 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||