Mus musculus Gene: Sox5 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197431.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sox5 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SRY-box containing gene 5 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A730017D01Rik; AI528773 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041540 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SRY-box containing gene 5
SRY-box containing gene 5
SRY-box containing gene 5
SRY-box containing gene 5
SRY-box containing gene 5
SRY-box containing gene 5
SRY-box containing gene 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000134532:
This gene encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryonic development and in the determination of the cell fate. The encoded protein may act as a transcriptional regulator after forming a protein complex with other proteins. The encoded protein may play a role in chondrogenesis. A pseudogene of this gene is located on chromosome 8. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:143828425-144781977 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | G3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1752 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001113559 NM_001243163 NM_011444 XM_006506931 XM_006506932 XM_006506933 XM_006506934 XM_006506935 XM_006506936 XM_006506937 XM_006506938 XM_006506939 XM_006506940 XM_006506941 XM_006506942 XM_006506943 XM_006506944 XM_006506945 XM_006506946 XM_006506947 XM_006536047 XM_006536048 XM_006536049 XM_006536050 XM_006536051 XM_006536052 XM_006536053 XM_006536054 XM_006536055 XM_006536056 XM_006536057 XM_006536058 XM_006536059 XM_006536060 XM_006536061 XM_006536062 XM_006536063 XM_006536064 XM_006536065 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS39702 CCDS51954 CCDS57469 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||