Homo sapiens Gene: SOX5 | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-23504.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SOX5 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SRY (sex determining region Y)-box 5 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | L-SOX5; L-SOX5B; L-SOX5F | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000134532 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
SRY (sex determining region Y)-box 5
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryonic development and in the determination of the cell fate. The encoded protein may act as a transcriptional regulator after forming a protein complex with other proteins. The encoded protein may play a role in chondrogenesis. A pseudogene of this gene is located on chromosome 8. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:23529500-23951032 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p12.1 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P35711 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5GWL1 T2CYZ2 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6660 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.434948 Hs.657542 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_152989 XM_006719149 XM_006719150 NM_001261414 NM_001261415 NM_006940 NM_178010 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11201 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604975 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44844 CCDS41761 CCDS58216 CCDS58217 CCDS8699 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 18086 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB081588 AB081589 AB081590 AB081591 AC087244 AC087260 AC087319 AC092864 AK074317 AK098610 AK303970 BC029220 BC035227 BC047665 BC060773 JX570584 S83308 X65662 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB49537 AAH29220 AAH35227 AAH47665 AAH60773 AGV38565 BAB85048 BAC05353 BAC16233 BAC16234 BAC16235 BAC16236 BAH14086 CAA46613 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6660 | ||||||||||||||||||||||||||