Mus musculus Gene: Slc8a1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-200127.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc8a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI852629; AV344025; D930008O12Rik; Ncx1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000054640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000183023:
In cardiac myocytes, Ca(2+) concentrations alternate between high levels during contraction and low levels during relaxation. The increase in Ca(2+) concentration during contraction is primarily due to release of Ca(2+) from intracellular stores. However, some Ca(2+) also enters the cell through the sarcolemma (plasma membrane). During relaxation, Ca(2+) is sequestered within the intracellular stores. To prevent overloading of intracellular stores, the Ca(2+) that entered across the sarcolemma must be extruded from the cell. The Na(+)-Ca(2+) exchanger is the primary mechanism by which the Ca(2+) is extruded from the cell during relaxation. In the heart, the exchanger may play a key role in digitalis action. The exchanger is the dominant mechanism in returning the cardiac myocyte to its resting state following excitation.[supplied by OMIM, Apr 2004] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:81388691-81649607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Calcium signaling pathway pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Protein digestion and absorption pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Reduction of cytosolic Ca++ levels pathway
Platelet homeostasis pathway
Sodium/Calcium exchangers pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Platelet calcium homeostasis pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Calcium signaling pathway pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Protein digestion and absorption pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3X9J1 Q8R505 Q91ZJ7 Q91ZQ6 Q9ET70 Q9ET71 Q9ET73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.265834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001286684 NM_011406 XM_006523932 XM_006523933 XM_006523934 XM_006523935 XM_006523936 XM_006523937 NM_001112798 XM_006523938 XM_006523939 XM_006523940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37706 CCDS50191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107956 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Slc8a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB030891 AB080744 AC122399 AC131656 AC175058 AF409089 AF423306 CH466537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAK98607 AAL18847 BAB08170 BAB08175 BAB08176 BAB85833 EDL38542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||