Mus musculus Gene: Calca | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-207270.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Calca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | calcitonin/calcitonin-related polypeptide, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CA; Calc; Calc1; Cgrp; CGRP-1; CGRP1; Ct; Ctn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calcitonin/calcitonin-related polypeptide, alpha
calcitonin/calcitonin-related polypeptide, alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] CALCA can be produced by immune cells such as monocytes/macrophages following inflammatory stimulation and has a positive or negative reciprocal effect on the production of other pro- and anti-inflammatory mediators, playing both facilitating and suppressing roles in immune and inflammatory responses as shown in mice.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110680:
This gene encodes the peptide hormones calcitonin, calcitonin gene-related peptide and katacalcin by tissue-specific alternative RNA splicing of the gene transcripts and cleavage of inactive precursor proteins. Calcitonin is involved in calcium regulation and acts to regulate phosphorus metabolism. Calcitonin gene-related peptide functions as a vasodilator while katacalcin is a calcium-lowering peptide. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Nov 2009] This gene encodes the peptide hormones calcitonin, calcitonin gene-related peptide and katacalcin by tissue-specific alternative RNA splicing of the gene transcripts and cleavage of inactive precursor proteins. Calcitonin is involved in calcium regulation and acts to regulate phosphorus metabolism. Calcitonin gene-related peptide functions as a vasodilator and as an antimicrobial peptide while katacalcin is a calcium-lowering peptide. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Aug 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:114631480-114636357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (s) signalling events pathway
GPCR downstream signaling pathway
Disease pathway
Signaling by GPCR pathway
Class B/2 (Secretin family receptors) pathway
Amyloids pathway
Calcitonin-like ligand receptors pathway
GPCR ligand binding pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
GPCR signaling pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (s) signalling events pathway
Calcitonin-like ligand receptors pathway
Class B/2 (Secretin family receptors) pathway
Amyloids pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
GPCR signaling pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001033954 NM_001289444 NM_007587 XM_006507272 XM_006507273 XM_006507274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21762 CCDS21763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||