Mus musculus Gene: Sgca | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209323.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sgca | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 50DAG; Asg | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001508 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein)
sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein)
sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein)
sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein)
sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the sarcoglycan alpha/epsilon family of transmembrane proteins. The encoded protein is part of the dystrophin-glycoprotein complex which links the extracellular matrix to the cytoskeleton in muscle fibers. Disruption of this gene results in progressive muscular dystrophy and is associated with the development of embryonal rhabdomysarcoma. [provided by RefSeq, Dec 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:94962791-94976327 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P82350 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5SWB0 Q5SWB4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20391 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.18709 Mm.406631 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009161 NM_001136080 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25266 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:894698 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Sgca | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB024920 AF019564 AF064081 AK075915 AL606480 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB70754 AAC33447 BAA83491 BAC36051 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20391 | ||||||||||||||||||||||