Mus musculus Gene: Ddx5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213550.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ddx5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2600009A06Rik; G17P1; Hlr1; HUMP68; p68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000108654:
microRNAs (miRNAs) are short (20-24 nt) non-coding RNAs that are involved in post-transcriptional regulation of gene expression in multicellular organisms by affecting both the stability and translation of mRNAs. miRNAs are transcribed by RNA polymerase II as part of capped and polyadenylated primary transcripts (pri-miRNAs) that can be either protein-coding or non-coding. The primary transcript is cleaved by the Drosha ribonuclease III enzyme to produce an approximately 70-nt stem-loop precursor miRNA (pre-miRNA), which is further cleaved by the cytoplasmic Dicer ribonuclease to generate the mature miRNA and antisense miRNA star (miRNA*) products. The mature miRNA is incorporated into a RNA-induced silencing complex (RISC), which recognizes target mRNAs through imperfect base pairing with the miRNA and most commonly results in translational inhibition or destabilization of the target mRNA. The RefSeq represents the predicted microRNA stem-loop. [provided by RefSeq, Sep 2009] DEAD box proteins, characterized by the conserved motif Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), are putative RNA helicases. They are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure, such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Based on their distribution patterns, some members of this family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. This gene encodes a DEAD box protein, which is a RNA-dependent ATPase, and also a proliferation-associated nuclear antigen, specifically reacting with the simian virus 40 tumor antigen. This gene consists of 13 exons, and alternatively spliced transcripts containing several intron sequences have been detected, but no isoforms encoded by these transcripts have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] DEAD box proteins, characterized by the conserved motif Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), are putative RNA helicases. They are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure, such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Based on their distribution patterns, some members of this family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. This gene encodes a DEAD box protein, which is a RNA-dependent ATPase, and also a proliferation-associated nuclear antigen, specifically reacting with the simian virus 40 tumor antigen. This gene consists of 13 exons, and alternatively spliced transcripts containing several intron sequences have been detected, but no isoforms encoded by these transcripts have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:106780355-106789185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 147 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Direct p53 effectors
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R1E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007840 XM_006532135 XM_006532136 XM_006532137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:105037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ddx5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL603664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||