Homo sapiens Gene: SNUPN | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-23512.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNUPN | ||||||||||||||||||
Gene Name | snurportin 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | KPNBL; RNUT1; Snurportin1 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000169371 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
snurportin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The nuclear import of the spliceosomal snRNPs U1, U2, U4 and U5, is dependent on the presence of a complex nuclear localization signal. The latter is composed of the 5'-2,2,7-terminal trimethylguanosine (m3G) cap structure of the U snRNA and the Sm core domain. The protein encoded by this gene interacts specifically with m3G-cap and functions as an snRNP-specific nuclear import receptor. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] The nuclear import of the spliceosomal snRNPs U1, U2, U4 and U5, is dependent on the presence of a complex nuclear localization signal. The latter is composed of the 5\'-2,2,7-terminal trimethylguanosine (m3G) cap structure of the U snRNA and the Sm core domain. The protein encoded by this gene interacts specifically with m3G-cap and functions as an snRNP-specific nuclear import receptor. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:75598083-75626469 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q24.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10073 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.21577 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001042581 NM_001042588 NM_005701 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14245 | ||||||||||||||||||
OMIM | 607902 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10281 | ||||||||||||||||||
HPRD | 07441 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10073 | ||||||||||||||||||