Homo sapiens Gene: COLEC12 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-285.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | COLEC12 | ||||||||||||||||||
Gene Name | collectin sub-family member 12 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000158270 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
collectin sub-family member 12
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
Summary |
Soluble COLEC12 can recognize Aspergillus fumigatus leading to activation of the alternative pathway of complement.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the C-lectin family, proteins that possess collagen-like sequences and carbohydrate recognition domains. This protein is a scavenger receptor, a cell surface glycoprotein that displays several functions associated with host defense. It can bind to carbohydrate antigens on microorganisms, facilitating their recognition and removal. It also mediates the recognition, internalization, and degradation of oxidatively modified low density lipoprotein by vascular endothelial cells. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:319361-500722 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p11.32 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
Scavenging by Class A Receptors pathway
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KEGG |
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.464422 Hs.620841 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_130386 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32782 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06358 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||