Homo sapiens Gene: LDLR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28808.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LDLR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | low density lipoprotein receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FH; FHC; LDLCQ2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
low density lipoprotein receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The low density lipoprotein receptor (LDLR) gene family consists of cell surface proteins involved in receptor-mediated endocytosis of specific ligands. Low density lipoprotein (LDL) is normally bound at the cell membrane and taken into the cell ending up in lysosomes where the protein is degraded and the cholesterol is made available for repression of microsomal enzyme 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A (HMG CoA) reductase, the rate-limiting step in cholesterol synthesis. At the same time, a reciprocal stimulation of cholesterol ester synthesis takes place. Mutations in this gene cause the autosomal dominant disorder, familial hypercholesterolemia. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:11089362-11133816 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Retinoid metabolism and transport pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
LDL-mediated lipid transport pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Visual phototransduction pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Metabolism pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
Disease pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
Bile secretion pathway
Toxoplasmosis pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.213289 Hs.713981 Hs.718832 Hs.738683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000527 NM_001195798 NM_001195799 NM_001195800 NM_001195803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12254 CCDS56083 CCDS56084 CCDS56085 CCDS58651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||