Homo sapiens Gene: VIMP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32368.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VIMP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | VCP-interacting membrane protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000131871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Selenoprotein S
Selenoprotein S
Selenoprotein S
Selenoprotein S
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a selenoprotein, which contains a selenocysteine (Sec) residue at its active site. The selenocysteine is encoded by the UGA codon that normally signals translation termination. The 3' UTR of selenoprotein genes have a common stem-loop structure, the sec insertion sequence (SECIS), that is necessary for the recognition of UGA as a Sec codon rather than as a stop signal. Studies suggest that this protein may regulate cytokine production, and thus play a key role in the control of the inflammatory response. Two alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:101270817-101277500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q26.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PN30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.32148 Hs.681699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_018445 NM_203472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 607918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 12133 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC023024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 55829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||