Homo sapiens Gene: RGMB | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-35165.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | RGMB | ||||||||||||||||||
Gene Name | RGM domain family, member B | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000174136 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RGM domain family, member B
RGM domain family, member B
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
Summary |
RGMB is highly expressed in macrophages and negatively regulates IL6 expression in a BMP ligand-dependent manner via MAPK and ERK pathway. (Demonstrated in murine model)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Rgmb is highly expressed in macrophages and negatively regulates Il6 expression in a BMP ligand-dependent manner via MAPK and ERK pathway.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
RGMB is a glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored member of the repulsive guidance molecule family (see RGMA, MIM 607362) and contributes to the patterning of the developing nervous system (Samad et al., 2005 [PubMed 15671031]).[supplied by OMIM, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:98768650-98798643 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q15 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Netrin-1 signaling pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.526902 Hs.600209 Hs.607986 Hs.636047 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001012761 XM_005271966 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47251 | ||||||||||||||||||
HPRD | 15243 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||