Homo sapiens Gene: MBD2 | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-3532.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MBD2 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | methyl-CpG binding domain protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DMTase; NY-CO-41 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000134046 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
methyl-CpG binding domain protein 2
methyl-CpG binding domain protein 2
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
DNA methylation is the major modification of eukaryotic genomes and plays an essential role in mammalian development. Human proteins MECP2, MBD1, MBD2, MBD3, and MBD4 comprise a family of nuclear proteins related by the presence in each of a methyl-CpG binding domain (MBD). Each of these proteins, with the exception of MBD3, is capable of binding specifically to methylated DNA. MECP2, MBD1 and MBD2 can also repress transcription from methylated gene promoters. The protein encoded by this gene may function as a mediator of the biological consequences of the methylation signal. It is also reported that the this protein functions as a demethylase to activate transcription, as DNA methylation causes gene silencing. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011] |
||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:54151601-54224788 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.2 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 56 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Promoter Opening pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
|
||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | X6RBL6 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8932 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.25674 Hs.606026 Hs.713852 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003927 NM_015832 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6917 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603547 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11953 CCDS45871 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04647 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC090666 AC093462 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8932 | ||||||||||||||||||||||||||