Homo sapiens Gene: CDKN2B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54658.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDKN2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CDK4I; INK4B; MTS2; P15; p15INK4b; TP15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000147883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4)
cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene lies adjacent to the tumor suppressor gene CDKN2A in a region that is frequently mutated and deleted in a wide variety of tumors. This gene encodes a cyclin-dependent kinase inhibitor, which forms a complex with CDK4 or CDK6, and prevents the activation of the CDK kinases, thus the encoded protein functions as a cell growth regulator that controls cell cycle G1 progression. The expression of this gene was found to be dramatically induced by TGF beta, which suggested its role in the TGF beta induced growth inhibition. Two alternatively spliced transcript variants of this gene, which encode distinct proteins, have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:22002903-22009363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 22 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cyclin D associated events in G1 pathway
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription pathway
Generic Transcription Pathway pathway
G1 Phase pathway
Cellular responses to stress pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Oncogene Induced Senescence pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
Cell Cycle pathway
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
Cellular Senescence pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
TGF-beta signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Small cell lung cancer pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
Hedgehog signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P42772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7PPU3 Q9UM95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004936 NM_078487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6512 CCDS6513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF004819 AF513858 AL449423 BC014469 CH471071 CR536529 JQ694046 JQ694047 JQ694048 JX391994 L36844 S69805 S75756 U17075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA50282 AAB69989 AAC50075 AAD14049 AAD14186 AAH14469 AAM44859 AFN61601 AFN61602 AFN61603 AGC10270 CAG38766 CAH70602 CAH70603 EAW58597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||