Homo sapiens Gene: NXT1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-59585.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NXT1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | NTF2-like export factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000132661 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
NTF2-like export factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is located in the nuclear envelope. It has protein similarity to nuclear transport factor 2. This protein functions as a nuclear export factor in both RAN (Ras-related nuclear protein)- and CRM1 (required for chromosome region maintenance)-dependent pathways. It is found to stimulate the export of U1 snRNA in RAN- and CRM1-dependent pathways and the export of tRNA and mRNA in a CRM1-independent pathway. The encoded protein heterodimerizes with Tap protein and may regulate the ability of Tap protein to mediate nuclear mRNA export. The use of alternate polyadenylation sites has been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:23350736-23354777 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p11.21 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UKK6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 29107 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_013248 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15913 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605811 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13150 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF156957 AL096677 BC000759 BC002687 BC003029 BC003410 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD54942 AAH00759 AAH02687 AAH03029 AAH03410 CAC03437 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 29107 | ||||||||||||||||||||||