Bos taurus Gene: TRPC4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-629819.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRPC4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Short transient receptor potential channel 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000009405 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Short transient receptor potential channel 4
Short transient receptor potential channel 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000133107:
This gene encodes a member of the canonical subfamily of transient receptor potential cation channels. The encoded protein forms a non-selective calcium-permeable cation channel that is activated by Gq-coupled receptors and tyrosine kinases, and plays a role in multiple processes including endothelial permeability, vasodilation, neurotransmitter release and cell proliferation. Single nucleotide polymorphisms in this gene may be associated with generalized epilepsy with photosensitivity. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:24049605-24194475 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRP channels pathway
Ion channel transport pathway
Netrin-1 signaling pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Axon guidance pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Netrin-1 signaling pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
Ion channel transport pathway
TRP channels pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Netrin-1 signaling pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Ion channel transport pathway
Axon guidance pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Developmental Biology pathway
TRP channels pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P79100 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6L6S3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 282102 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.4556 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174478 XM_005213550 XM_005213551 XM_005213552 XM_005213553 XM_005213554 XM_005213555 XM_005213556 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB179745 AJ224862 X99792 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAD19015 CAA12161 CAA68125 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 282102 | ||||||||||||||||||||||