Bos taurus Gene: PRDM16 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634734.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRDM16 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000018965 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PR domain containing 16
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000142611:
The reciprocal translocation t(1;3)(p36;q21) occurs in a subset of myelodysplastic syndrome (MDS) and acute myeloid leukemia (AML). This gene is located near the 1p36.3 breakpoint and has been shown to be specifically expressed in the t(1:3)(p36,q21)-positive MDS/AML. The protein encoded by this gene is a zinc finger transcription factor and contains an N-terminal PR domain. The translocation results in the overexpression of a truncated version of this protein that lacks the PR domain, which may play an important role in the pathogenesis of MDS and AML. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:50847258-50898579 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | D2STE2 F1MTF1 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 100137803 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.86636 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002694178 XM_003583245 XM_005194846 XM_005217192 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02043191 DAAA02043192 FJ812033 | ||||||||||||||||||||
GenPept | ACZ55140 | ||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 100137803 | ||||||||||||||||||||