Bos taurus Gene: EPHB3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634976.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EPHB3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ephrin type-B receptor 3 precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000005313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
EPH receptor B3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000182580:
Ephrin receptors and their ligands, the ephrins, mediate numerous developmental processes, particularly in the nervous system. Based on their structures and sequence relationships, ephrins are divided into the ephrin-A (EFNA) class, which are anchored to the membrane by a glycosylphosphatidylinositol linkage, and the ephrin-B (EFNB) class, which are transmembrane proteins. The Eph family of receptors are divided into two groups based on the similarity of their extracellular domain sequences and their affinities for binding ephrin-A and ephrin-B ligands. Ephrin receptors make up the largest subgroup of the receptor tyrosine kinase (RTK) family. This gene encodes a receptor for ephrin-B family members. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:83202439-83244544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Developmental Biology pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Axon guidance pathway
Ephrin signaling pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Ephrin signaling pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
EPHB forward signaling
EphrinB-EPHB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1ML02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 540907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.44462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02001875 DAAA02001876 DAAA02001877 DAAA02001878 DAAA02001879 DAAA02001880 DAAA02001881 DAAA02001882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 540907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||