Bos taurus Gene: DHX36 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-637479.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DHX36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | probable ATP-dependent RNA helicase DHX36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000006142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
probable ATP-dependent RNA helicase DHX36
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] DHX36 interacts with CpG-A and is associated with IFN-alpha production and IRF7 nuclear translocation upon CpG-A stimulation. DHX36 localizes within the cytosol and directly binds to the TLR domain of MYD88.
[Homo sapiens] DHX36 is a component of a cytosolic viral sensor and is recruited to a complex consisting of DDX1, DDX21 and TICAM1, which triggers type I interferon and cytokine response to dsRNA. (Demonstrated in murine model)
[Mus musculus] Dhx36 is a component of a cytosolic viral sensor and is recruited to a complex consisting of Ddx1, Ddx21 and Ticam1, which triggers type I interferon and cytokine response to dsRNA.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000174953:
This gene is a member of the DEAH-box family of RNA-dependent NTPases which are named after the conserved amino acid sequence Asp-Glu-Ala-His in motif II. The protein encoded by this gene has been shown to enhance the deadenylation and decay of mRNAs with 3'-UTR AU-rich elements (ARE-mRNA). The protein has also been shown to resolve into single strands the highly stable tetramolecular DNA configuration (G4) that can form spontaneously in guanine-rich regions of DNA. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:114236034-114281045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q05B79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 509583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.103344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001080251 XM_005201792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC122652 DAAA02002573 DAAA02002574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI22653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 509583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||